РАЗРАБОТКА ПРАЙМЕРОВ И ЗОНДОВ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ ВИРУСА ККГЛ МЕТОДОМ ОТ-ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ
Ключевые слова:
диагностика, ККГЛ, праймер, зонд, от-ПЦР РВАннотация
Конго-Крымская геморрагическая лихорадка (ККГЛ) – смертельная вирусная инфекция с летальностью от 10 до 40% при передаче клещами и до 80% при внутрибольничной передаче. Случаи заболевания у людей зарегистрированы более чем в 30 странах Европы, Азии и Африки. Быстрая и точная диагностика ККГЛ необходима для правильного лечения, прогнозирования исхода заболевания и предотвращения дальнейшего распространения инфекции. Молекулярные методы, такие как полимеразная цепная реакция (ПЦР), получили широкое применение относительно инфекционных заболеваний. Целью данной работы являлась разработка новых праймеров и зондов, которые будут применены для быстрого и специфичного выявления РНК вируса ККГЛ методом одношагового ОТПЦР в режиме реального времени. После оптимизации и проведения лабораторных испытаний, разработанные олигонуклеотиды могут обеспечить эффективное выявление вируса ККГЛ в клинических образцах.
Библиографические ссылки
Bente D.A., et al. Crimean-Congo hemorrhagic fever: history, epidemiology, pathogenesis, clinical syndrome and genetic diversity. Antiviral Res. 2013;100(1):159–89.
Mazzola L.T., Kelly-Cirino C. Diagnostic tests for Crimean-Congo haemorrhagic fever: a widespread tickborne disease. BMJ Global Health. 2019; 4: e001114. https://doi.org/10.1136/bmjgh-2018-001114.
Chinikar S., Mirahmadi R., Moradi M., et al. Crimean-Congo Hemorrhagic Fever (CCHF), Zoonosis. IntechOpen 2012. https://doi.org/10.5772/2125.
Whitehouse C.A. Crimean–Congo hemorrhagic fever. Antiviral Res 2004; 64:145–60. https://doi.org/10.1016/S0166-3542(04)00163-9.
Al-Abri S.S., Abaidani I.A., Fazlalipour M., et al. Current status of crimean-congo haemorrhagic fever in the world health organization eastern mediterranean region: issues, challenges, and future directions. Int J Infect Dis 2017; 58:82–9. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2017.02.018.
Ergonul O. Crimean-Congo hemorrhagic fever virus: new outbreaks, new discoveries. Curr Opin Virol 2012; 2:215–20. https://doi.org/10.1016/j.coviro.2012.03.001.
Mertens M, Schmidt K, Ozkul A, et al. The impact of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus on public health. Antiviral Res 2013; 98:248–60. https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2013.02.007.
Suschak J.J., et al. A CCHFV DNA vaccine protects against heterologous challenge and establishes GP38 as immunorelevant in mice. npj Vaccines. 2021;6(1):31.
Flick R., Whitehouse C.A. Crimean-Congo hemorrhagic fever virus. Curr Mol Med. 2005;5(8):753–60.
Papa A., Papadopoulou E., Tsioka K., Kontana A., Pappa S., Melidou A., Giadinis N.D. Isolation and whole-genome sequencing of a Crimean-Congo hemorrhagic fever virus strain, Greece. Ticks tick-borne Dis. 2018;9(4):788–91.
Papa A., Ma B., Kouidou S., Tang Q., Hang C., Antoniadis A. Genetic characterization of the M RNA segment of Crimean congo hemorrhagic fever virus strains, China. Emerg Infect Dis. 2002;8(1):50.
Hewson R., Gmyl A., Gmyl L., Smirnova S.E., Karganova G., Jamil B., Hasan R., Chamberlain J., Clegg C. Evidence of segment reassortment in Crimean-Congo haemorrhagic fever virus. J Gen Virol. 2004;85(10):3059–70.
Deyde VM, Khristova ML, Rollin PE, Ksiazek TG, Nichol S.T. Crimean-Congo hemorrhagic fever virus genomics and global diversity. J Virol. 2006;80(17):8834–42.
Carroll S.A., Bird B.H., Rollin P.E., Nichol ST. Ancient common ancestry of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus. Mol Phylogenet Evol. 2010;55(3):1103–10.
Anagnostou V, Papa A. Evolution of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus. Infect Genet Evol. 2009; 9(5):948–54.
Portillo A., Palomar A.M., Santibáñez P, Oteo JA. Epidemiological aspects of Crimean-Congo hemorrhagic fever in Western Europe: what about the future? Microorganisms 2021, 9(3):649.
Gruber C.E., et al. Geographical variability affects CCHFV detection by RT–PCR: a Tool for In-Silico evaluation of molecular assays. Viruses. 2019;11(10):953.
Sánchez-Seco M.P., et al. Widespread detection of multiple strains of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in ticks, Spain. Emerg Infect Dis. 2022;28(2):394.
Norouzi M., et al. Recent advances on nanomaterials-based fluorimetric approaches for microRNAs detection. Mater Sci Engineering: C. 2019;104:110007.
Osman H.A., et al. Development and evaluation of loop-mediated isothermal amplification assay for detection of Crimean Congo hemorrhagic fever virus in Sudan. J Virol Methods. 2013;190(1–2):4–10.
Jafari A., et al. Molecular detection of Crimean-Congo haemorrhagic fever (CCHF) virus in hard ticks from South Khorasan, east of Iran 2022.
Febrer-Sendra B., Fernández-Soto P., et al. A Novel RT-LAMP for the Detection of Different Genotypes of Crimean–Congo Haemorrhagic Fever Virus in Patients from Spain. Intern. Journal of Molecular Sciences. 2023; 24(7):6411. https://doi.org/10.3390/ijms24076411.
